Von großer Bedeutung für die unterdurchschnittliche Wertschöpfung, die auch mit unterdurchschnittlichen Steuereinnahmen und überdurchschnittlichen Sozialausgaben in der Region einhergeht, ist die schwach ausgebaute Forschungs- und Entwicklungsinfrastruktur.
In Ostthüringen existiert kein Institut der großen Deutschen Forschungsgemeinschaften und Hochschulen wurden erst spät errichtet: 1998 wurde, zunächst ausschließlich für die duale akademisch-berufliche Ausbildung, eine Berufsakademie in Thüringen mit Standorten in Gera und Eisenach gegründet, die 2016 in die Duale Hochschule Gera-Eisenach umgewandelt wurde. 2006 wurde darüber hinaus, ebenfalls in Gera, die SRH Hochschule für Gesundheit gegründet.